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王嘉寅 |
工程与复杂系统运营管理、生物信息计算与数字健康、生物信息学与生物信息管理、健康管理与政策。
王嘉寅，博士，计算机科学与技术学院教授、博士生导师，国际合作与交流处副处长，兼任陕西省医疗健康大数据工程研究中心副主任。
王嘉寅同志是西安市委统战部认定的无党派人士，现任或曾担任陕西省人大代表（2023-），西安市政协委员（2022-），全国青联委员（2020-），陕西省青联委员（2020-）、西安市青年联合会副主席（2018-）；是重点人才计划入选者；曾获得陕西省杰出青年科学基金、获得5822yh银河国际“青年拔尖人才支持计划”等项目资助。
王嘉寅教授及其团队主要从事大数据驱动的医疗人工智能技术与全周期疾病和健康管理的研究和实践，曾参与TCGA PanCanAtlas、ICGC等国际大科学计划。主要包括：
1）肿瘤组学数据的分析技术、质量管理技术与生物信息软件的调度和优化方法；
2）肿瘤、出生缺陷等基因疾病的诊断、治疗中的辅助决策方法和演化预测建模；
3）面向康养全程的疾病监控、风险评估和复发预警方法。
教育和工作经历
1. 2021/10-，5822yh银河国际计算机科学与技术学院，教授，博士生导师
2. 2018/03-2021/10，5822yh银河国际计算机科学与技术系/学院，准聘教职，博士生导师
3. 2015/10-2018/02，5822yh银河国际管理学院，准聘教职，博士生导师
4. 2013/06-2015/09，美国圣路易斯华盛顿大学医学院基因组研究所，博士后，合作导师Li Ding教授
5. 2009/08-2013/05，美国康涅狄格大学，计算机科学与工程系生物信息学方向，研究生/博士，导师Yufeng Wu教授
6. 2004/09-2008/07，5822yh银河国际，计算机科学与技术，本科/学士
1.国家自然科学基金重大项目，智慧医疗健康管理理论与方法，医联网环境下的数据治理与数据跨域分析，72293581, 2023/01-2027/12，参加
2.陕西省自然科学基础研究计划，杰出青年科学基金项目，2020JC-01，大数据驱动的肿瘤临床辅助决策，2020/01-2022/12，主持
3.国家自然科学基金青年项目，31701150，复杂子克隆结构的肿瘤体细胞突变测序数据与多表型的双向聚类关联分析方法研究，2018/01-2020/12，主持
4.国家重点研发计划“干细胞与转化研究”重点专项，2017YFA0105800，膀胱尿路上皮组织干细胞突变特征与演化研究，2017/07-2021/12，参加
1. 王嘉寅(9/10); 智能化移动微创装备关键技术及产业化, 安徽省人民政府, 安徽省技术发明奖, 一等奖, 2018 (丁帅; 傅强; 唐华; 杨善林; 付超; 张林; 孙晓; 范雯娟; 王嘉寅; 吴德胜).
2. Shenjie Wang, Yuqian Liu, Juan Wang*, Xiaoyan Zhu, Yuzhi Shi, Xuwen Wang, Tao Liu, Xiao Xiao, Jiayin Wang*. Is an SV caller compatible with sequencing data? An online recommendation tool to automatically recommend the optimal caller based on data features, Frontiers in Genetics 13, Article Number: 1096797, January 2023. 本研究首次提出生物信息学软件的推荐问题，实验证明，随着生物信息学软件日益丰富，如果在分析软件选择上缺乏科学性，容易在数据分析中引入系统性偏差。
3. Xuwen Wang, Ying Xu, Ruoyu Liu, Xin Lai, Yuqian Liu, Shenjie Wang, Xuanping Zhang, Jiayin Wang*. PEcnv: Accurate and efficient detection of copy number variations of various lengths, Briefings in Bioinformatics 23, Issue 5, Article Number: bbac375, September 2022. 本研究首次提出，通过优化生物信息学软件的内部参数，可以显著提高软件的适用范围和性能表现。
4. TMB猫科动物大集合：系列研究首次提出适用于中国人群的TMB阳性判断值审评策略。
Yixuan Wang#, Jiayin Wang#, Wenfeng Fang#, Xiao Xiao, Quan Wang, Jian Zhao, Jingjing Liu, Shuanying Yang, Yuqian Liu*, Xin Lai*, Xiaofeng Song*. TMBserval: a statistical explainable learning model reveals weighted tumor mutation burden better categorizing therapeutic benefits, Frontiers in Immunology 14, Article Number: 1151755, May 2023.
Yixuan Wang#, Xin Lai#, Jiayin Wang*, Ying Xu, Xuanping Zhang, Xiaoyan Zhu, Yuqian Liu, Yang Shao*, Li Zhang, Wenfeng Fang*. TMBcat: A joint p-value criterion based on different distance metrics for superiorly inferring tumor mutation burden thresholds, Frontiers in Immunology 13, Article Number: 995180, September 2022.
5. Feng Xie#, Jianjun Zhang#, Jiayin Wang#, Alexandre Reuben#, Wei Xu#, Xin Yi, Frederick S. Varn, Yongsheng Ye, Junwen Cheng, Miao Yu, Yue Wang, Yufeng Liu, Mingchao Xie, Peng Du, Ke Ma, Xin Ma, Penghui Zhou, Shengli Yang, Yaobing Chen, Guoping Wang, Xuefeng Xia, Zhongxing Liao, John V. Heymach, Ignacio I. Wistuba, P. Andrew Futreal, Kai Ye*, Chao Cheng*, Tian Xia*. Multifactorial deep learning reveals pan-cancer genomic tumor clusters with distinct immunogenomic landscape and response to immunotherapy, Clinical Cancer Research 26, Issue 12, pp. 2908-2920, June 2020.
6. The ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes Consortium. Pan-cancer analysis of whole genomes, Nature 578, Issue 7793, pp. 82-93, February 2020.
7. Yi Huang#, Jiayin Wang#, Peilin Jia, Xiangchun Li, Guangsheng Pei, Changxi Wang, Xiaodong Fang, Zhongming Zhao, Zhiming Cai, Xin Yi, Song Wu, Baifeng Zhang*. Clonal architectures predict clinical outcome in clear cell renal cell carcinoma, Nature Communications 10, Article number: 1245, March 2019.
8. Kuan-lin Huang, R. Jay Mashl, Yige Wu, Deborah Ritter, Jiayin Wang, Clara Oh, Marta Paczkowska, Sheila Reynolds, Matthew Wyczalkowski, Ninad Oak, Adam Scott, Michal Krassowski, Andrew Cherniack, Kathleen Houlahan, Reyka Jayasinghe, Liang-Bo Wang, Daniel Cui Zhou, Di Liu, Song Cao, Young Won Kim, Amanda Koire, Joshua McMichael, Vishwanathan Hucthagowder, Tae-Beom Kim, Abigail Hahn, Chen Wang, Michael McLellan, Fahd Al-Mulla, Kimberly Johnson, The Cancer Genome Atlas Research Network, Olivier Lichtarge, Paul Boutros, Benjamin Raphael, Alexander Lazar, Wei Zhang, Michael Wendl, Ramaswamy Govindan, Sanjay Jain, David Wheeler, Shashikant Kulkarni, John Dipersio, Juri Reimand, Funda Meric-Bernstam, Ken Chen, Ilya Shmulevich, Sharon Plon, Feng Chen*, Li Ding*. Pathogenic germline variants in 10,389 adult cancers, Cell 173, Issue 2, pp. 355-370, April 2018.
9. Mingchao Xie#, Charles Lu#, Jiayin Wang#, Michael McLellan, Kimberly Johnson, Michael Wendl, Joshua McMichael, Heather Schmidt, Venkata Yellapantula, Christopher Miller, Bradley Ozenberger, John Welch, Daniel Link, Matthew Walter, Elaine Mardis, John DiPersio, Feng Chen, Richard Wilson, Timothy Ley, Li Ding*. Age-related cancer mutations associated with clonal hematopoietic expansion and malignancies, Nature Medicine 20, Number 12, pp. 1472-1478, December 2014.
